紅樹林是指生長在海河交界的耐鹽性植物。目前台灣現存的紅樹林只有四種:水筆仔、欖李、海茄苳及五梨跤。從台南市沿海北起八掌溪口,南至曾文溪口,海岸地區風浪較小,浮洲、湖、河口沼澤地特多,泥沙在河口沿海淤積,成為紅樹林落腳繁衍的好地方。分別分布在北門區生長於急水溪口的淺沼泥地,樹種為海茄苳、水筆仔;將軍區生長於將軍溪口,樹種為水筆仔、海茄苳;七股區生長於海寮港及海埔地魚塭內路溝岸曾文溪口粘沼泥地,散生五公頃海茄苳、欖李等。紅樹林內蘊藏大量的礦物質和有機物,是彈塗魚、招潮蟹的天堂。市府每年仍將繼續以人工復育方式,                
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